Formation “Microorganismes amis ou ennemis ?”
Les microorganismes, bien qu’invisibles à l'œil nu, représentent une large variété d'espèces. Des virus aux bactéries en passant par les archées, sans vous en rendre compte, vous cohabitez avec eux quotidiennement. Mais bien que souvent associés aux maladies, ces organismes peuvent se révéler indispensables pour tous. L’objectif de la formation était d’en apprendre plus sur la diversité de ces microorganismes, leur importance ainsi que les moyens utilisés pour les étudier.
JOUR 1 - Diversité des microorganismes et microbiotes
Le premier jour de formation était consacré à la découverte de la diversité des microorganismes et leurs interactions avec l’Homme. Pendant la matinée, les enseignants ont pu tester un jeu permettant de catégoriser ces derniers comme pathogènes ou bénéfiques pour l’espèce humaine. Une classification des types de microorganismes a aussi pu être réalisée permettant alors d’apprivoiser les différentes familles auxquelles ils appartiennent.
Par la suite, Esther Marza, chercheuse à l’IECB (UMR Microbiologie fondamentale et pathogénicité) nous a partagé son savoir scientifique, permettant alors d’éclairer les participants sur les différents types de microorganismes, leur évolution ainsi que leurs rôles dans certaines maladies. Cela a permis de mieux appréhender le sujet du jour et d’avoir une meilleure compréhension de ce qu’est un microorganisme.
L’après-midi était consacrée au microbiote, cette communauté de microorganismes logée dans le corps humain et qui lui bénéficie. Thomas Pradeu, philosophe des sciences au laboratoire ImmunoConcept (CNRS, Université de Bordeaux) a abordé la notion du soi et du non-soi, centrale à l’immunologie et qui aujourd’hui est mise à l’épreuve par le microbiote. Les participants ont ainsi pu porter un nouveau regard sur le concept d’individu biologique.
En conclusion de cette première journée, Mauricette Mesguich, ingénieure de formation à la Maison pour la science en Aquitaine a proposé différents ateliers sur le microbiote, permettant par groupe et avec l’aide d’une carte mentale, d'indiquer où il était présent, chez quels organismes, comment l’étudier et ses effets sur la santé et le cerveau.
JOUR 2 - Visite de l’IECB et ressources pour la classe
Lors de cette deuxième journée de formation, les enseignants ont eu l’occasion, le temps d’une matinée, de visiter l’IECB (Institut Européen de Chimie et Biologie). Cette visite, effectuée par Nathanaël Benoit et Louis Rouillan, doctorants à l’IECB, et accompagnée par Esther Marza, leur a permis de découvrir de plus près les méthodes d’étude des microorganismes. Ils ont pu découvrir notamment la cryo-microscopie électronique à transmission ayant une résolution permettant d’aller jusqu’à reconstituer des modèles atomiques et de déterminer des structures moléculaires 3D afin de les étudier et comprendre le rôle de molécules d’intérêt. Les participants ont pu observer toutes les étapes allant de la préparation des échantillons à leur observation. Une présentation de cette technique en amont par Esther Marza leur a permis de mieux appréhender la visite.
La formation s’est poursuivie dans l’après-midi par la présentation de ressources utilisables par les professeurs auprès de leurs élèves, comme le projet “Aux origines des maladies”, présenté par Mauricette Mesguich et explorant les facteurs de risques liés aux maladies. Les professeurs se sont notamment essayés à un jeu sur les facteurs impliqués dans le développement des caries.
Dans la continuité, Sandra Pécastaingts, professeure de SVT au lycée Montaigne à Bordeaux a présenté différentes ressources autour de la vaccination et de la propagation des maladies. Les participants ont pu se familiariser à la modélisation de cette propagation en calculant le taux de reproduction de base (R0) grâce à la durée de contagion, le taux de contact et la transmissibilité.
Pour clore la formation, les enseignants ont joué au jeu collaboratif patient zéro ayant pour but de retrouver le patient zéro d’une épidémie. Une variante avec des tubes à essai représentant par échange de fluides les différents contacts humains et permettant une révélation visuelle des personnes contaminées a été mise en œuvre.
Merci aux intervenants extérieurs d’avoir répondu présent et permis d’enrichir cette formation.
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